Регулятор сопротивления. Регулятор множественной лекарственной устойчивости RamR: структура и механизм действия

Как RamR регулирует экспрессию генов множественной лекарственной устойчивости. Какова структура RamR и как он взаимодействует с различными лекарствами. Как связывание лекарств влияет на активность RamR. Какое значение имеет RamR для множественной лекарственной устойчивости бактерий.

Содержание

Структура и функции регулятора RamR

RamR является важным регулятором множественной лекарственной устойчивости у бактерий. Этот белок выполняет следующие ключевые функции:

  • Действует как репрессор транскрипции гена ramA
  • Контролирует экспрессию системы множественного оттока лекарств acrAB-tolC
  • Связывается с различными антибиотиками и другими лекарственными соединениями
  • При связывании с лекарствами снижает свое сродство к ДНК, что приводит к усилению экспрессии генов устойчивости

Кристаллическая структура RamR была определена в комплексе с несколькими лекарственными соединениями. Это позволило выявить ключевые особенности строения белка:


  • RamR имеет гибкую область для распознавания различных субстратов
  • Ключевым остатком для взаимодействия с лекарствами является Phe155
  • Разные соединения окружены различными аминокислотными остатками в сайте связывания

Механизм взаимодействия RamR с лекарственными соединениями

Исследование структуры RamR в комплексе с различными лекарствами выявило следующие особенности взаимодействия:

  • Все изученные соединения взаимодействуют с остатком Phe155 RamR
  • Каждое соединение окружено уникальным набором аминокислотных остатков
  • Связывание лекарств снижает сродство RamR к ДНК
  • Это приводит к усилению экспрессии гена ramA, кодирующего активатор системы множественного оттока

Таким образом, RamR обладает значительной гибкостью в области распознавания субстратов, что позволяет ему взаимодействовать с широким спектром соединений.

Роль RamR в развитии множественной лекарственной устойчивости

RamR играет ключевую роль в формировании множественной лекарственной устойчивости бактерий:

  • Регулирует экспрессию системы множественного оттока AcrAB-TolC
  • При связывании с антибиотиками снимает репрессию с генов устойчивости
  • Это приводит к усилению оттока антибиотиков из клетки
  • Способен взаимодействовать с различными классами антибиотиков
  • Обеспечивает быстрый ответ на присутствие антибиотиков в среде

Понимание механизма действия RamR важно для разработки новых подходов к преодолению множественной лекарственной устойчивости бактерий.


Структурные особенности комплексов RamR с различными лекарствами

Анализ кристаллических структур RamR в комплексе с разными соединениями выявил следующие особенности:

  • Берберин связывается в гидрофобном кармане, образованном остатками Phe155, Tyr59 и Tyr92
  • Кристаллический фиолетовый взаимодействует с Phe155 и окружен остатками Tyr59, Tyr92 и Asn100
  • Деквалиний формирует контакты с Phe155, Tyr59 и Tyr92
  • Бромид этидия располагается между Phe155 и Tyr92
  • Родамин 6G взаимодействует с Phe155 и окружен Tyr59, Tyr92 и Asn100

Эти данные демонстрируют пластичность сайта связывания RamR и его способность приспосабливаться к разным лигандам.

Влияние связывания лекарств на активность RamR

Связывание лекарственных соединений с RamR приводит к следующим эффектам:

  • Снижение сродства RamR к ДНК
  • Снятие репрессии с промотора гена ramA
  • Усиление экспрессии RamA — активатора системы множественного оттока
  • Повышение экспрессии генов acrAB и tolC
  • Усиление оттока антибиотиков из бактериальной клетки

Таким образом, связывание лекарств запускает каскад событий, приводящий к формированию множественной лекарственной устойчивости.


Значение RamR для изучения и преодоления антибиотикорезистентности

Исследование RamR имеет большое значение для борьбы с антибиотикорезистентностью:

  • Позволяет понять молекулярные механизмы развития множественной устойчивости
  • Выявляет новые мишени для создания ингибиторов систем множественного оттока
  • Дает возможность разрабатывать соединения, блокирующие активацию RamR
  • Помогает прогнозировать развитие устойчивости к новым антибиотикам
  • Открывает пути для создания более эффективных комбинаций антибиотиков

Дальнейшее изучение RamR и подобных регуляторов необходимо для преодоления проблемы антибиотикорезистентности.

Перспективы использования RamR в качестве мишени для новых антибактериальных препаратов

RamR представляет собой перспективную мишень для разработки новых антибактериальных средств:

  • Ингибирование RamR может повысить чувствительность бактерий к антибиотикам
  • Блокирование связывания лекарств с RamR предотвратит активацию систем оттока
  • Модификация RamR может нарушить регуляцию генов устойчивости
  • Создание соединений, стабилизирующих комплекс RamR-ДНК, усилит репрессию генов устойчивости
  • Комбинация ингибиторов RamR с антибиотиками может преодолеть множественную устойчивость

Разработка препаратов, нацеленных на RamR, может стать важным направлением в борьбе с антибиотикорезистентностью бактерий.



Регулятор сопротивления для аппарата пайки

К сравнению

В избранное

Категории: Литьевое оборудование

  • Характеристики

С этим товаром также покупают

Корневертка MAILLEFER

90 ₽

0

Сверла спиральные HSS в тубусе (10 шт.
)

240 ₽

0

Наждачная бумага SIA

Влагостойкая
Лист: 275х230 мм

70 ₽

0

Проволока для замочков 1 м.

100 ₽

0

Пальцемер пластиковый 36 размера 3-х цветный

300 ₽

0

Трос для рукава на бормашину «FOREDOM»

390 ₽

0

Пилки SUPER Q (дюжина)

Длина: 130 мм

218 ₽

0

Каучук круглый (1 м)

50 ₽

0

Тигель шамотно-глиняный (10 шт)

400 ₽ 500 ₽

0

Реактив кислотный (10 мл)

160 ₽

0

Шланг резиновый бензостойкий черный (1 м)

Внутренний диаметр 6 мм.

150 ₽

0

02-103 Щетка крацовочная черн. волос. мягкая на держателе Ø22 мм.

45 ₽

0

Измеритель-регулятор одноканальный ТР432‑ТС

Описание товара

Один канал измерения и регулирования, тип входных датчиков — термопреобразователи сопротивления, ПИД регулятор, двухпозиционное управление (релейное), автонастройка, работа по заданной термической программе.

Узнать цены

Отправить запрос

  • Описание
  • Характеристики
  • Загрузки

Измеритель-регулятор ТР432 имеет один вход для подключения термопары, один выход для управления внешним устройством и независимый внешний таймер, но основное его отличие от терморегуляторов предыдущих серий — это наличие режима работы по термической программе. При помощи этого режима можно реализовать практически любой технологический процесс работы печи, который может состоять, к примеру, из следующих участков — нагрев от одной температуры до другой за заданное время (ограничение скорости нагрева), удержание печью заданной температуры в течение заданного времени, и далее охлаждение печи.

Особенности прибора:

  • Один канал измерения-регулирования
  • Высокая точность измерения и поддержания температуры
  • Не требуется юстировка и калибровка. Точность измерения достигается за счет применения высококачественных элементов
  • Гальваническая развязка канала регулирования
  • Возможность управления как нагревателем, так и охладителем
  • Возможность реализации термической программы
  • Автонастройка коэффициентов ПИД регулятора
  • Настраиваемый входной цифровой фильтр измерительного канала
  • Область применения: пищевая, химическая промышленность, лабораторное и технологическое оборудование
  • Выпускается специальная модификация прибора со встроенным таймером для работы в составе фасовочного оборудования

Индикация

7-сегментная светодиодная; 1 строка 4 разряда

Тип управления

Релейное 2-х позиционное.
ПИД регулятор.
По термической программе.

Поддерживаемые термопреобразователи сопротивления

50П
100П
500П
46П (гр. 21)
50М
100М
53М (гр. 23)
Pt50
Pt100
2 х Pt100
Pt500
Pt1000
Cu50
Cu100
100Н

Поддерживаемые унифицированные сигналы

0…100 мВ
0…1 В
0…5 В
0…10 В
1…5 В
2,4…12,6 В
–5…+5 В
–10…+10 В
0…5 мА
0…20 мА
4…20 мА
-5…+5 мА

Класс точности термопреобразователей сопротивления

0.25/0.1

Класс точности унифицированных сигналов

0.5/0.1

Варианты выходных устройств

Электромагнитное реле (250 В, 50 Гц, 8 А).
Симисторная оптопара (600 В пикового значения переменного тока 50 Гц, 100 мА).
Симисторная оптопара (600 В пикового значения переменного тока 50 Гц, 1,5 А).
Твердотельное реле (260 В, 50 Гц, 100 мА; 400 В, 100 мА постоянного тока).
Транзисторная оптопара структуры n-p-n типа (50 В, 50 мА).
Открытый коллектор транзистора структуры p-n-p типа (50 В, 100 мА).

Напряжение питания, В

90…245 В, переменное.
9…40 В, постоянное.
7…30 В, переменное.

Габаритные размеры, мм

96х48х105

Способ монтажа

Щитовой монтаж

Гарантийный срок эксплуатации

5 лет со дня продажи

TR432_doc_2014_03_11.pdf (530.09 КБ)

Стоимость продукции

ТР432-ТС1-Р1/Р1

Срок производства 7 рабочих дней

Цена: По запросу

Сроки производства и цены на остальные модификации изделий предоставляются по запросу.

Кристаллическая структура регулятора множественной лекарственной устойчивости RamR с несколькими препаратами

. 2013;4:2078.

дои: 10.1038/ncomms3078.

Сугуру Ямасаки 1 , Эйдзи Никайдо, Рёске Накашима, Кейсуке Сакураи, Дайсуке Фудзивара, Икуо Фуджи, Кунихико Нишино

Принадлежности

принадлежность

  • 1 Лаборатория микробиологии и инфекционных заболеваний, Отдел специальных проектов, Институт научных и промышленных исследований Осакского университета, 8-1 Михогаока, Ибараки, Осака 567-0047, Япония.
  • PMID: 23800819
  • DOI: 10. 1038/ncomms3078

Бесплатная статья

Сугуру Ямасаки и др. Нац коммун. 2013.

Бесплатная статья

. 2013;4:2078.

дои: 10.1038/ncomms3078.

Авторы

Сугуру Ямасаки 1 , Эйдзи Никайдо, Рёске Накашима, Кейсуке Сакураи, Дайсуке Фудзивара, Икуо Фуджи, Кунихико Нишино

принадлежность

  • 1 Лаборатория микробиологии и инфекционных заболеваний, отдел специальных проектов, Институт научных и промышленных исследований Осакского университета, 8-1 Михогаока, Ибараки, Осака 567-0047, Япония.
  • PMID: 23800819
  • DOI: 10.1038/ncomms3078

Абстрактный

RamR является репрессором транскрипции гена, кодирующего белок RamA, который контролирует экспрессию генов системы множественного оттока лекарств acrAB-tolC. RamR является важным фактором множественной лекарственной устойчивости, однако его структура и идентичность молекул, на которые он реагирует, неизвестны. Здесь мы сообщаем о кристаллической структуре RamR в комплексе с несколькими препаратами, включая берберин, кристаллический фиолетовый, деквалиний, бромид этидия и родамин 6G. Обнаружено, что все соединения взаимодействуют с Phe155 RamR, и каждое соединение окружено разными аминокислотными остатками. Связывание этих соединений с RamR снижает его сродство к ДНК-связыванию, что приводит к повышенной экспрессии ramA. Наши результаты показывают значительную гибкость в области распознавания субстрата RamR, которая регулирует бактериальный отток, участвующий в множественной лекарственной устойчивости.

Похожие статьи

  • Опосредованная желчью активация генов множественного оттока лекарств acrAB и tolC происходит в основном за счет транскрипционной дерепрессии ramA у Salmonella enterica serovar Typhimurium.

    Бошерон С., Нишино К., Моншо И., Канепа С., Морель М.С., Кост Ф., Руссель А., Клокарт А., Жиро Э. Бошерон С. и др. J Антимикробная химиотерапия. 2014 сен; 69 (9): 2400-6. дои: 10.1093/як/дку140. Epub 2014 9 мая. J Антимикробная химиотерапия. 2014. PMID: 24816212

  • Мутации ramR, вовлеченные в опосредованную оттоком множественную лекарственную устойчивость у Salmonella enterica serovar Typhimurium.

    Абузед Ю.М., Бошерон С., Клокарт А. Абузид Ю.М. и соавт. Противомикробные агенты Chemother. 2008 июль; 52 (7): 2428-34. doi: 10.1128/AAC.00084-08. Epub 2008, 28 апреля. Противомикробные агенты Chemother. 2008. PMID: 18443112 Бесплатная статья ЧВК.

  • Кристаллическая структура регулятора множественной лекарственной устойчивости RamR в комплексе с желчными кислотами.

    Ямасаки С., Накашима Р., Сакураи К., Бошерон С., Жиро Э., Дублет Б., Клокарт А., Нишино К. Ямасаки С. и др. Научный представитель 2019 г. 17 января; 9 (1): 177. doi: 10.1038/s41598-018-36025-8. Научный представитель 2019. PMID: 30655545 Бесплатная статья ЧВК.

  • Связывание репрессора RamR с промоторами дикого типа и мутантными промоторами гена RamA, участвующего в опосредованной оттоком множественной лекарственной устойчивости у Salmonella enterica serovar Typhimurium.

    Baucheron S, Coste F, Canepa S, Maurel MC, Giraud E, Culard F, Castaing B, Roussel A, Cloeckaert A. Бошерон С. и др. Противомикробные агенты Chemother. 2012 г., февраль; 56 (2): 942-8. doi: 10.1128/AAC.05444-11. Epub 2011 28 ноября. Противомикробные агенты Chemother. 2012. PMID: 22123696 Бесплатная статья ЧВК.

  • Расшифровка молекулярной основы мультилекарственного распознавания: кристаллические структуры Staphylococcus aureus мультилекарственного связывания регулятора транскрипции QacR.

    Шумахер М.А., Бреннан Р.Г. Шумахер М.А. и соавт. Рез микробиол. 2003 март; 154(2):69-77. doi: 10.1016/S0923-2508(02)00013-X. Рез микробиол. 2003. PMID: 12648720 Обзор.

Посмотреть все похожие статьи

Цитируется

  • Цикличность антибиотиков влияет на эволюцию резистентности независимо от побочной чувствительности.

    Брепольс П., Апперманс К., Перес-Ромеро К.А., Лори Б., Маршал К., Стинакерс Х.П. Брепольс П. и др. Мол Биол Эвол. 5 декабря 2022 г .; 39 (12): msac257. doi: 10.1093/molbev/msac257. Мол Биол Эвол. 2022. PMID: 36480297 Бесплатная статья ЧВК.

  • Расширение семейства плазмид pRAS3 в Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida и растущие доказательства межвидовых связей этих плазмид.

    Фурнье К.С., Паке В.Е., Аттер С.А., Фарли Дж., Маркиз Х., Гантеле Х., Раваль С., Винсент А.Т., Шаретт С.Дж. Фурнье К.С. и соавт. Антибиотики (Базель). 2022 3 августа; 11 (8): 1047. doi: 10.3390/антибиотики11081047. Антибиотики (Базель). 2022. PMID: 36009916 Бесплатная статья ЧВК.

  • Использование взаимозаменяемых биосенсоров для улучшения биосинтеза алкалоидов.

    d’Oelsnitz S, Kim W, Burkholder NT, Javanmardi K, Thyer R, Zhang Y, Alper HS, Ellington AD. d’Oelsnitz S, et al. Nat Chem Biol. 2022 сен;18(9):981-989. doi: 10.1038/s41589-022-01072-w. Epub 2022 7 июля. Nat Chem Biol. 2022. PMID: 35799063

  • Динамическое логическое моделирование показывает влияние энергоснабжения на экспрессию бактериального эффлюксного насоса.

    Керр Р., Джаббари С., Блэр Дж.М.А., Джонстон И.Г. Керр Р. и соавт. Интерфейс JR Soc. 2022 Янв;19(186):20210771. doi: 10.1098/rsif.2021.0771. Epub 2022 26 января. Интерфейс JR Soc. 2022. PMID: 35078338 Бесплатная статья ЧВК.

  • Функции и механизмы торможения эффлюксных насосов с множественными лекарственными средствами.

    Нишино К. , Ямасаки С., Накашима Р., Звама М., Хаяси-Нишино М. Нишино К. и др. Фронт микробиол. 2021 3 декабря; 12:737288. doi: 10.3389/fmicb.2021.737288. Электронная коллекция 2021. Фронт микробиол. 2021. PMID: 34925258 Бесплатная статья ЧВК. Обзор.

Просмотреть все статьи «Цитируется по»

Типы публикаций

термины MeSH

вещества

Регулятор множественной антибиотикорезистентности MarR представляет собой медный сенсор Escherichia coli

  1. Мартин Р.Г., Нянтаки П.С. и Рознер, Дж. Л. Регуляция множественной устойчивости к антибиотикам ( mar ) регулона с помощью последовательностей marORA в Кишечная палочка . J. Бактериол. 177 , 4176–4178 (1995).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  2. Алексхун М.Н. и Леви, С.Б. Регуляция хромосомно-опосредованной множественной устойчивости к антибиотикам: регулон mar . Антимикроб. Агенты Чемотер. 41 , 2067–2075 (1997).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  3. Перера, И.К. и Гроув, А. Молекулярные механизмы лиганд-опосредованного ослабления связывания ДНК регуляторами транскрипции семейства MarR. Дж. Мол. Клеточная биол. 2 , 243–254 (2010).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  4. Cohen, S.P., Levy, S.B., Foulds, J. & Rosner, J.L. Индукция устойчивости к антибиотикам салицилатом у Escherichia coli : активация mar оперон и mar -независимый путь. J. Бактериол. 175 , 7856–7862 (1993).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  5. Алексхун М.Н. и Леви, С.Б. Регулон mar : множественная устойчивость к антибиотикам и другим ядохимикатам. Тенденции микробиол. 7 , 410–413 (1999).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  6. Мартин Р.Г. и Рознер, Дж. Л. Связывание очищенного белка-репрессора множественной устойчивости к антибиотикам (MarR) с последовательностями оператора mar . Проц. Натл. акад. науч. США 92 , 5456–5460 (1995).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  7. Алексхун М.Н. и Леви, С.Б. Изменение репрессорной активности MarR, негативного регулятора Локус Escherichia coli marRAB , по нескольким химическим веществам in vitro . J. Бактериол. 181 , 4669–4672 (1999).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  8. Прайс, C.T.D., Lee, I.R. и Густафсон, Дж. Э. Влияние салицилата на бактерии. Междунар. Дж. Биохим. Клеточная биол. 32 , 1029–1043 (2000).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  9. Натан, К. и Каннингем-Бассел, А. Помимо окислительного стресса: руководство для иммунолога по активным формам кислорода. Нац. Преподобный Иммунол. 13 , 349–361 (2013).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  10. Кохански, М.А., Дуайер, Д.Дж., Хайете, Б., Лоуренс, К.А. и Коллинз, Дж.Дж. Распространенный механизм гибели клеток, вызванный бактерицидными антибиотиками. Cell 130 , 797–810 (2007).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  11. Дуайер, Д.Дж., Кохански, М.А. и Коллинз, Дж.Дж. Роль активных форм кислорода в действии антибиотиков и резистентности. Курс. мнение микробиол. 12 , 482–489 (2009).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  12. Лю, Ю. и Имлей, Дж.А. Гибель клеток от антибиотиков без участия активных форм кислорода. Наука 339 , 1210–1213 (2013).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  13. Керен И., Ву Ю., Иносенсио Дж., Малкахи Л.Р. & Lewis, K. Уничтожение бактерицидными антибиотиками не зависит от активных форм кислорода. Наука 339 , 1213–1216 (2013).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  14. Д’Отрео, Б. и Толедано, М.Б. АФК как сигнальные молекулы: механизмы, которые генерируют специфичность в гомеостазе АФК. Нац. Преподобный Мол. Клеточная биол. 8 , 813–824 (2007).

    Артикул пабмед Google Scholar

  15. Pomposiello, PJ & Demple, B. Генетические переключатели, управляемые окислительно-восстановительным потенциалом: транскрипционные факторы SoxR и OxyR. Тенденции биотехнологии. 19 , 109–114 (2001).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  16. Chen, P.R. et al. Механизм восприятия окисления используется глобальным регулятором MgrA в Staphylococcus aureus . Нац. хим. биол. 2 , 591–595 (2006).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  17. Ли, Дж.-В. и Helmann, JD. Фактор транскрипции PerR воспринимает h3O2 посредством окисления гистидина, катализируемого металлами. Природа 440 , 363–367 (2006).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  18. Кохански, М.А., ДеПристо, М.А. и Коллинз, Дж.Дж. Сублетальное лечение антибиотиками приводит к множественной лекарственной устойчивости посредством радикального мутагенеза. Мол. Cell 37 , 311–320 (2010).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  19. Мартин Р.Г., Джаир К.В., Вольф Р.Е. и Рознер, Дж. Л. Автоактивация оперона множественной устойчивости к антибиотикам marRAB активатором транскрипции MarA в Escherichia coli . J. Бактериол. 178 , 2216–2223 (1996).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  20. Уверский В.Н., Винтер С. и Лебер Г. Самоассоциация молекул 8-анилино-1-нафталинсульфоната: спектроскопическая характеристика и применение для исследования фолдинга белков. Биохим. Биофиз. Acta 1388 , 133–142 (1998).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  21. Сяо З., Лафлин Ф., Джордж Г.Н., Хоулетт Г.Дж. & Wedd, A.G. С-концевой домен мембранного переносчика меди Ctr1 из Saccharomyces cerevisiae связывает четыре иона Cu(I) в виде многоядерного кластера тиолата меди: субфемтомолярное сродство Cu(I) трех белков, участвующих в переносе меди. Дж. Ам. хим. соц. 126 , 3081–3090 (2004).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  22. Риддлс, П. В., Блейкли, Р. Л. и Зернер, Б. Повторная оценка реактива Эллмана. Методы Фермент. 91 , 49–60 (1983).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  23. Дин Х., Се Х. и Канг Ю. Дж. Значение хелаторов меди в клиническом и экспериментальном применении. Дж. Нутр. Биохим. 22 , 301–310 (2011).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  24. Алексхун М.Н., Леви С.Б., Мили Т.Р., Ситон Б.А. & Хед, Дж. Ф. Кристаллическая структура MarR, регулятора множественной устойчивости к антибиотикам, с разрешением 2,3 Å. Нац. Структура биол. 8 , 710–714 (2001).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  25. Хонг, М., Фуангтонг, М., Хелманн, Дж. Д. и Бреннан, Р. Г. Структура комплекса операторов OhrR–ohrA раскрывает механизм связывания ДНК семейства MarR. Мол. Cell 20 , 131–141 (2005).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  26. Кумаревел Т., Танака Т., Умехара Т. и Йокояма С.С.Т. Кристаллическая структура комплекса 1710–ДНК раскрывает механизм связывания с ДНК регуляторов семейства MarR. Рез. нуклеиновых кислот. 37 , 4723–4735 (2009).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  27. Долан, К. Т., Дугид, Э. М. и Хе, К. Кристаллические структуры белка SlyA, основного регулятора вирулентности Salmonella , в свободном и ДНК-связанном состояниях. J. Biol. хим. 286 , 22178–22185 (2011).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  28. Дуайер, Д.Дж., Кохански, М.А., Хайете, Б. и Коллинз, Дж.Дж. Ингибиторы гиразы индуцируют окислительный путь гибели клеток в Escherichia coli . Мол. Сист. биол. 3 , 91 (2007).

    Артикул пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  29. Цзэн Л., Миллер Э.В., Пралле А., Исакофф Э.Ю. и Чанг, С. Дж. Селективный флуоресцентный датчик включения для визуализации меди в живых клетках. Дж. Ам. хим. соц. 128 , 10–11 (2006).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  30. Кохански, М.А., Дуайер, Д.Дж., Вежбовски, Дж., Коттарел, Г. и Коллинз, Дж.Дж. Неправильная трансляция мембранных белков и активация двухкомпонентной системы запускают гибель клеток, опосредованную антибиотиками. Cell 135 , 679–690 (2008).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  31. Кершоу, С.Дж., Браун, Н.Л., Константиниду, К., Патель, М.Д. и Хобман, Дж.Л. Профиль экспрессии Escherichia coli K-12 в ответ на минимальные, оптимальные и избыточные концентрации меди. Микробиология 151 , 1187–1198 (2005).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  32. Родригес-Монтелонго, Л. , де ла Крус-Родригес, Л.К., Фариас, Р.Н. & Massa, E.M. Связанный с мембраной окислительно-восстановительный цикл меди опосредует токсичность гидропероксида у Escherichia coli. Биохим. Биофиз. Acta 1144 , 77–84 (1993).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  33. Родригес-Монтелонго, Л., Р.Н. и Масса, Е.М. Сайты переноса электронов на мембраносвязанную медь и вызванное гидропероксидом повреждение дыхательной цепи Кишечная палочка . Арх. Биохим. Биофиз. 323 , 19–26 (1995).

  34. Walling, C. Повторное посещение реагента Фентона. Согл. хим. Рез. 8 , 125–131 (1975).

    Артикул КАС Google Scholar

  35. Patikarnmonthon, N. et al. Ионы меди усиливают токсичность органического гидропероксида и пероксида водорода посредством различных механизмов у Xanthomonas campestris 9. 0174 пп. кампестрис . FEMS микробиол. лат. 313 , 75–80 (2010).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  36. Раписарда В.А. и другие. Доказательства лигирования Cu (I)-тиолата и предсказание предполагаемого сайта связывания меди в Escherichia coli NADH-дегидрогеназе-2. Арх. Биохим. Биофиз. 405 , 87–94 (2002).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  37. Родригес-Монтелонго Л., Волентини С.И., Фариас Р.Н., Масса Э.М. и Раписарда В.А. Cu(II)-редуктаза НАДН-дегидрогеназа-2 из Escherichia coli улучшает рост бактерий при экстремальных концентрациях меди и повышает устойчивость к повреждениям, вызванным медью и гидропероксидом. Арх. Биохим. Биофиз. 451 , 1–7 (2006).

    Артикул пабмед Google Scholar

  38. Чжао, Б. С. и другие. Высокоселективный флуоресцентный зонд для визуализации органических гидропероксидов в живых клетках. Дж. Ам. хим. соц. 132 , 17065–17067 (2010).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  39. Домен, Ф., Бина, X.Р. и Леви, С.Б. Транскетолаза А, фермент центрального метаболизма, дерепрессирует оперон множественной устойчивости к антибиотикам marRAB Escherichia coli при взаимодействии с MarR. Мол. микробиол. 66 , 383–394 (2007).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  40. Frawley, E.R. et al. Экспорт железа и цитрата главным вспомогательным насосом надсемейства регулирует метаболизм и устойчивость к стрессу у Salmonella Typhimurium. Проц. Натл. акад. науч. США 110 , 12054–12059 (2013 г.).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  41. Сан, Ф. и др. Чувствительный к кворуму agr опосредует реакцию бактериального окисления посредством внутримолекулярного дисульфидного окислительно-восстановительного переключателя в регуляторе реакции AgrA. Проц. Натл. акад. науч. США 109 , 9095–9100 (2012 г.).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  42. Дэн Х. и др. Количественная оценка всего протеома и характеристика чувствительных к окислению цистеинов в патогенных бактериях. Микроб-хозяин клетки 13 , 358–370 (2013).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  43. Винтер, Дж., Илберт, М., Граф, П.К.Ф., Озчелик, Д. и Якоб, У. Отбеливатель активирует редокс-регулируемый шаперон за счет окислительного разворачивания белка. Cell 135 , 691–701 (2008).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  44. Хиникер А. , Колле Ж.-Ф. и Бардуэлл, J.C.A. Медный стресс вызывает потребность in vivo в дисульфидизомеразе Escherichia coli DsbC. J. Biol. хим. 280 , 33785–33791 (2005 г.).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  45. Мелони, Г. и др. Замена металлов между Zn7-металлотионеином-3 и амилоид-β-Cu защищает от токсичности амилоида-β. Нац. хим. биол. 4 , 366–372 (2008).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  46. Баттье, Т.Г.Г., Контояннис, Л., Джонсон, О., Пауэлл, Х.Р. и Лесли, А.Г.В. iMOSFLM: новый графический интерфейс для обработки дифракционных изображений с помощью MOSFLM. Acta Кристаллогр. Д биол. Кристаллогр. 67 , 271–281 (2011).

    Артикул КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  47. Winn, MD et al. Обзор пакета CCP4 и текущих разработок. Acta Кристаллогр. Д биол. Кристаллогр. 67 , 235–242 (2011).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  48. Маккой, А.Дж. и другие. Кристаллографическая программа Phaser. J. Appl. Кристаллогр. 40 , 658–674 (2007).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  49. Муршудов Г.Н., Вагин А.А. и Додсон, Э.Дж. Уточнение макромолекулярных структур методом максимального правдоподобия. Acta Кристаллогр. Д биол. Кристаллогр. 53 , 240–255 (1997).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  50. Эмсли П. и Коутан К. Кут: инструменты построения моделей для молекулярной графики. Acta Кристаллогр. Д биол. Кристаллогр. 60 , 2126–2132 (2004).

    ПабМед Google Scholar

  51. Ласковски Р.А., Макартур М.В., Мосс Д.С. и Торнтон Дж.М. PROCHECK: программа для проверки стереохимического качества белковых структур. J. Appl. Кристаллогр. 26 , 283–291 (1993).

    КАС Google Scholar

  52. Клейвегт, Г.Дж. Использование некристаллографической симметрии для уточнения структуры белков. Acta Кристаллогр. Д биол. Кристаллогр. 52 , 842–857 (1996).

    Артикул КАС пабмед Google Scholar

  53. Пейнтер, Дж. и Мерритт, Э.А. Оптимальное описание структуры белка с точки зрения нескольких групп, подвергающихся движению TLS. Акта Кристаллогр. Д биол. Кристаллогр. 62 , 439–450 (2006).

    Артикул пабмед Google Scholar

  54. Чен В.

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *